Das Landwirtschaftmodell RAUMIS basiert auf  Daten der Agrarstrukturerhebung, der Bodennutzungshaupterhebung, der Ernte- und Betriebsberichterstattung für Feldfrüchte und Grünland, der Düngemittelhandelsstatistik, der landwirtschaftlichen Gesamtrechnung sowie vom Kuratorium für Technik und Bauwesen in der Landwirtschaft (KTBL). Die für die hydrologischen Modelle notwendigen Daten zu Klima, Topographie, Bodenbedeckung, Bodenparametern, hydrogeologischen Parametern, Gewässergütedaten, Grund- und Oberflächenwasserkörpern wurden flächendeckend für die gesamte FGE Weser von den Weseranrainerländern und vom Deutschen Wetterdienst bereitgestellt. Der Eintrag von Pflanzennährstoffen in die Gewässer ist immer an die Komponenten des Abflusses gebunden. Aufgrund des unterschiedlichen physikalisch/chemischen Verhaltens von Stickstoffverbindungen (vor allem Nitrat) und Phosphorverbindungen (vor allem Phosphat) kommt den einzelnen Abflusskomponenten eine unterschiedliche Bedeutung als Eintragspfad zu.
Basis für die Analyse der Nährstoffeinträge bildet ein langfristiger 20 - 30-jähriger mittlerer Wasserhaushalt, um Einflüsse wie z.B klimatische Schwankungen und Extremereignisse (Extreme Trockenjahre) zu vermeiden. Es handelt sich hierbei um einen quasistationären durchschnittlichen Zustand des Wasserhaushalts in der FGE Weser.